神经生物学（针灸）实验室是国家中医药管理局批准的三级中医药科研实验室，定位于针灸基础与技术研究，是安徽中医药大学针灸推拿学院（康复医学院）科研平台的重要组成部分。实验室包含4个研究方向：腧穴主治规律与作用机制研究、经脉脏腑相关研究、针灸临床作用机制及应用技术研究、灸法作用机理及临床研究。其中腧穴主治规律及作用机制研究方向重点关注腧穴的临床主治规律、腧穴的协同作用及腧穴作用机制等关键科学问题；经脉-脏腑相关研究方向运用多学科的先进技术与方法，开展经络理论、经脉脏腑相关及其与脑功能联系的研究；针灸临床作用机制及应用技术研究方向运用现代技术和方法，对针灸的量效、时效关系进行临床观察与实验研究，探讨不同针灸方法的临床疗效及作用机制，为针灸的临床运用提供科学依据；灸法作用机理及临床研究方向在前期承担了2个“973”计划项目子课题“艾灸温通效应规律及其原理研究”、“艾灸热光烟效应及其生物学机制研究”的基础上开展进一步的研究。该实验室与国内多家院校相关实验室建立了良好的协作关系，实验室先后承办多次全国性学术会议，并接待国内外多名著名专家学者来访，实验室研究人员亦多次参加全国性学术会议及受邀访问多国进行学术交流。实验室承担针灸推拿学专业学术型硕士研究生培养，并承担培养部分中医学（针灸方向）博士研究生。已形成以神经电生理、心功能检测和微透析技术等为优势特色技术的科研平台，并向校内外开放。